<div>Dear PaoloU,</div>  <div> </div>  <div>Thanks for your help. I now still have some puzzlements about the procedure of </div>  <div>calculating vibrationl spectrum by finite electric field method.</div>  <div> </div>  <div>1.I consider a model structure of tetrahedral amorphous carbon obtained by my schoolmate using a Car-Parrinello molecular dynamics approach.    </div>  <div> </div>  <div>2.When running a self-consistent calculation for this structure (using different exchange-crrelation energy and pseudopotential with in CPMD), I found the forces and stress are big.<BR>In this case, I should use pw.x to compute the equilibrium geometry <BR>before running finite electric field method to calculate Raman tensor. Is it right?<BR> <BR>   Total force =     0.633437     Total SCF correction =     0.000080</div>  <div>   total   stress 
 (Ry/bohr**3)                   (kbar)     P=  -69.10<BR>  -0.00087420   0.00095392  -0.00017791       -128.60    140.33    -26.17<BR>   0.00095392   0.00033110   0.00005680        140.33     48.71      8.35<BR>  -0.00017791   0.00005680  -0.00086609        -26.17      8.35   -127.41</div>  <div> </div>  <div>3.I run a vc-relax calculation and input and output files are as follows.<BR>It is obvious the cell angle parameters have been changed and the structure isn't the cubic structure. </div>  <div> </div>  <div>(1)ATOMIC_POSITIONS (angstrom)<BR>&CONTROL<BR> 
 calculation  = "vc-relax",<BR>  prefix       = "ta-c",<BR>  pseudo_dir   = "/home/niuli/espresso-3.2/pseudo",<BR>  outdir       = "/home/niuli/tmp",<BR>  etot_conv_thr=1.0D-4,<BR>  forc_conv_thr=1.0D-5<BR>  tstress = .true. ,<BR>  tprnfor = .true. ,<BR>                       nstep = 65 ,<BR>                       dt = 50 ,<BR>/<BR>&SYSTEM<BR>    ibrav = 1, <BR>    celldm(1) = 13.9103, <BR>    nat= 64, ntyp= 1,<BR>    ecutwfc =55    <BR>/<BR>&ELECTRONS<BR>  conv_thr    = 1.D-9,<BR>  mixing_beta = 0.7D0,<BR>/<BR>&IONS<BR> 
 <BR>/<BR>&CELL<BR>               cell_dynamics = 'damp-w' ,<BR>                      press = 0.0 ,<BR>/<BR>ATOMIC_SPECIES<BR> C   12.0107  C.pz-mt.UPF</div>  <div>ATOMIC_POSITIONS (angstrom)<BR> C      0.335930     -0.353760     -0.911160<BR> C      1.410315     -0.756669      3.705328<BR> C     -0.462432      3.049465     -0.168292<BR>  ...<BR>K_POINTS automatic<BR>1 1 1 0 0 0<BR>----------------------------------------------------------<BR>final unit-cell volume =   2649.6086 (a.u.)^3<BR>  input alat =      13.9103
 (a.u.)</div>  <div>CELL_PARAMETERS (alat)<BR>   0.988103212   0.021498496  -0.002655708<BR>   0.021493430   1.013103454  -0.000556700<BR>  -0.002655491  -0.000556401   0.983829644</div>  <div>ATOMIC_POSITIONS (angstrom)<BR>C        0.292559767  -0.288781798  -0.891844186<BR>C        1.355532741  -0.743068572   3.628414295<BR>C       -0.355484435   3.081913445  -0.167170533<BR>C        0.095087835   3.109571795   3.835737135<BR>C        4.156057825   0.859970231  -0.191362362<BR>...<BR>-------------------------------------------------------------<BR>(2)ATOMIC_POSITIONS (crystal)</div>  <div><BR>CELL_PARAMETERS (alat)<BR>   0.997839246  
 0.002690608  -0.000417664<BR>   0.002690608   1.001016967   0.000136231<BR>  -0.000417664   0.000136231   0.997967842<BR> <BR>ATOMIC_POSITIONS (crystal)<BR>C        0.040549747  -0.039126226  -0.123246079<BR>C        0.194302645  -0.104600063   0.504317492<BR>C       -0.056833511   0.414314558  -0.024646663<BR>C        0.005446848   0.417400176   0.531096601<BR>C        0.569734741   0.101952019  -0.026079258<BR>C        0.849788292   0.163379218   0.703668015<BR>C        0.572774545   0.583287732  
 0.029202254<BR>...<BR>------------------------------------------------------------</div>  <div>4.If I set ibrav=0 and use the obtained new cell parameter and atomic positions in the next scf calculation, the results on forces and stress are the same with that in vc-relax.<BR>But if I set ibrav=1 in the next scf calculation, how to read the new lattice constant?<BR> <BR>5. Then run ph.x code to obtain the phonon frequencies and eigenmodes. The phonon density of states is also obtained by dynmat.x code.<BR>In your papers,the dynamical matrix is calculated by taking finite differences of atomic forces for atomic displacements of a constant bohr.What is the difference between two methods?<BR> Why don't you use the linear response method(ph.x code) to calculate the vibrational properties? </div>  <div> </div>  <div>6. Supposing I obtain the equilibrium geometry of ibrav= 1, I then can calculate Raman tensor by considering second derivatives of the
 atomic forces(cp.x code).<BR> <BR>Is my thought right on the procedure of calculating?<BR> <BR>Best wishes,</div>  <div> </div>  <div>Niu Li<BR>Harbin Institute of Technology<BR>China<BR></div><p>



      <hr size=1><a href="http://cn.mail.yahoo.com" target=blank>ÇÀ×¢ÑÅ»¢Ãâ·ÑÓÊÏä3.5GÈÝÁ¿£¬20M¸½¼þ£¡</a>