<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2963" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Amin,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>In addition to Axel's suggustions, you may need to 
add -D__MPI option too.</FONT></DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Huiqun</FONT> </DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
<DIV>----- Original Message ----- </DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV 
  style="BACKGROUND: #e4e4e4; FONT: 10pt arial; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A title=babazade@gmail.com href="mailto:babazade@gmail.com">Amin 
  Babazadeh</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A title=pw_forum@pwscf.org 
  href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Sunday, December 10, 2006 10:04 
  PM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> Re: [Pw_forum] use doual 
  core</DIV>
  <DIV><BR></DIV>
  <DIV>Dear friends</DIV>
  <DIV>I am so sorry for this but i couldn't solve my problem.</DIV>
  <DIV>i installed lam 7.1.2 in my computer and i didn't change the installation 
  PATH.</DIV>
  <DIV>after that i configure the espresso.this file has been made.</DIV>
  <P># make.sys.  Generated from <A 
  href="http://make.sys.in">make.sys.in</A> by configure.</P>
  <P># compilation rules</P>
  <P>.SUFFIXES :<BR>.SUFFIXES : .o .c .f .f90</P>
  <P># most fortran compilers can directly preprocess c-like directives: 
  use<BR>#  $(MPIF90) $(F90FLAGS) -c $<<BR># if explicit preprocessing 
  by the C preprocessor is needed, use:<BR>#  $(CPP) $(CPPFLAGS) $< -o 
  $*.F90 <BR># $(MPIF90) $(F90FLAGS) -c $*.F90 -o $*.o<BR># remember the 
  tabulator in the first column !!!</P>
  <P>.f90.o:<BR> $(MPIF90) $(F90FLAGS) -c $<</P>
  <P># .f.o and .c.o: do not modify</P>
  <P>.f.o:<BR> $(F77) $(FFLAGS) -c $<</P>
  <P>.c.o:<BR> $(CC) $(CFLAGS)  -c $<</P>
  <P><BR># DFLAGS  = precompilation options (possible arguments to -D and 
  -U)<BR>#           used by 
  the C compiler and preprocessor<BR># FDFLAGS = as DFLAGS, for the f90 
  compiler<BR># See include/defs.h.README for a list of options and their 
  meaning <BR># With the exception of IBM xlf, FDFLAGS = $(DFLAGS)<BR># For IBM 
  xlf, FDFLAGS is the same as DFLAGS with separating commas </P>
  <P>DFLAGS         =  -D__INTEL 
  -D__FFTW 
  -D__USE_INTERNAL_FFTW<BR>FDFLAGS        = 
  $(DFLAGS)</P>
  <P># IFLAGS = how to locate directories where files to be included are<BR># In 
  most cases, IFLAGS = -I../include<BR># If loading an external FFTW library, 
  add the location of FFTW include files</P>
  <P>IFLAGS         = -I../include </P>
  <P># MODFLAGS = flag used by f90 compiler to locate modules<BR># You need to 
  search for modules in ./, in ../iotk/src, in ../Modules<BR># Some applications 
  also neeed modules in ../PW, ../PH, ../CPV</P>
  <P>MODFLAGS       = -I./  
  -I../Modules  -I../iotk/src 
  \<BR>                 
  -I../PW  -I../PH  -I../CPV</P>
  <P># Compilers: fortran-90, fortran-77, C<BR># If a parallel compilation is 
  desired, MPIF90 should be a fortran-90 <BR># compiler that produces 
  executables for parallel execution using MPI<BR># (such as for instance 
  mpif90, mpf90, mpxlf90,...); <BR># otherwise, an ordinary fortran-90 compiler 
  (f90, g95, xlf90, ifort,...)<BR># If you have a parallel machine but no 
  suitable candidate for MPIF90,<BR># try to specify the directory containing 
  "mpif.h" in IFLAGS <BR># and to specify the location of MPI libraries in 
  MPI_LIBS</P>
  <P>MPIF90         = 
  ifort<BR>#F90           = 
  ifort<BR>CC             
  = cc<BR>F77            
  = ifort</P>
  <P># C preprocessor and preprocessing flags - for explicit preprocessing, 
  <BR># if needed (see the compilation rules above)<BR># preprocessing flags 
  must include DFLAGS and IFLAGS</P>
  <P>CPP            = 
  cpp<BR>CPPFLAGS       = -P -traditional 
  $(DFLAGS) $(IFLAGS)</P>
  <P># compiler flags: C, F90, F77<BR># C flags must include DFLAGS and 
  IFLAGS<BR># F90 flags must include MODFLAGS, IFLAGS, and FDFLAGS with 
  appropriate syntax</P>
  <P>CFLAGS         = -O3 $(DFLAGS) 
  $(IFLAGS)<BR>F90FLAGS       = $(FFLAGS) 
  -nomodule -fpp $(FDFLAGS) $(IFLAGS) 
  $(MODFLAGS)<BR>FFLAGS         = -O2 
  -tpp6 -assume byterecl</P>
  <P># compiler flags without optimization for fortran-77<BR># the latter is 
  NEEDED to properly compile dlamch.f, used by lapack</P>
  <P>FFLAGS_NOOPT   = -O0 -assume byterecl</P>
  <P># Linker and linker-specific flags (if any)<BR># Typically LD coincides 
  with F90 or MPIF90 - not actually used</P>
  <P># 
  LD             = 
  ifort<BR>LDFLAGS        = </P>
  <P># External Libraries (if any) : blas, lapack, fft, MPI</P>
  <P># If you have nothing better, use the local copy : ../flib/blas.a</P>
  <P>BLAS_LIBS      = ../flib/blas.a</P>
  <P># The following lapack libraries will be available in flib/ :<BR># 
  ../flib/lapack.a : contains all needed routines<BR># ../flib/lapack_atlas.a: 
  only routines not present in the Atlas library<BR># For IBM machines with 
  essl: load essl BEFORE lapack ! <BR># remember that LAPACK_LIBS precedes 
  BLAS_LIBS in loading order</P>
  <P>LAPACK_LIBS    = ../flib/lapack.a</P>
  <P># nothing needed here if the the internal copy of FFTW is compiled<BR># 
  (needs -D__FFTW -D__USE_INTERNAL_FFTW in DFLAGS)</P>
  <P>FFT_LIBS       = </P>
  <P># For parallel execution, the correct path to MPI libraries must<BR># be 
  specified in MPI_LIBS (except for IBM if you use mpxlf)</P>
  <P>MPI_LIBS       = </P>
  <P># IBM-specific: MASS libraries, if available and if -D__MASS is defined in 
  FDFLAGS</P>
  <P>MASS_LIBS      = </P>
  <P># pgplot libraries (used by some post-processing tools)</P>
  <P>PGPLOT_LIBS    = </P>
  <P># ar command and flags - for most architectures: AR = ar, ARFLAGS = 
  ruv<BR># ARFLAGS_DYNAMICS is used in iotk to produce a dynamical library,<BR># 
  for Mac OS-X with PowerPC and xlf compiler. In all other cases<BR># 
  ARFLAGS_DYNAMICS = $(ARFLAGS) </P>
  <P>AR             
  = ar<BR>ARFLAGS        = 
  ruv<BR>ARFLAGS_DYNAMIC= ruv</P>
  <P># ranlib command. If ranlib is not needed (it isn't in most cases) use<BR># 
  RANLIB = echo</P>
  <P>RANLIB         = ranlib</P>
  <P># all internal and external libraries - do not modify</P>
  <P>LIBOBJS        = ../flib/ptools.a 
  ../flib/flib.a ../clib/clib.a 
  ../iotk/src/libiotk.a<BR>LIBS           
  = $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FFT_LIBS) $(MPI_LIBS) $(MASS_LIBS) 
  $(PGPLOT_LIBS)</P>
  <P>i saw that for mpif90 and F77, ifort compiler want to use so i change 
  all of them to mpif77. and i compiled <A href="http://it.by">it.by</A> doing 
  that i could use both of my computer's cpu but this error was hapen at the end 
  of my runs. </P>
  <P>It seems that [at least] one of the processes that was started 
  with<BR>mpirun did not invoke MPI_INIT before quitting (it is possible 
  that<BR>more than one process did not invoke MPI_INIT -- mpirun was 
  only<BR>notified of the first one, which was on node n0). </P>
  <P>mpirun can *only* be used with MPI programs (i.e., programs that<BR>invoke 
  MPI_INIT and MPI_FINALIZE).  You can use the "lamexec" program<BR>to run 
  non-MPI programs over the lambooted 
  nodes.<BR>----------------------------------------------------------------------------- 
  <BR>forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)<BR>mpirun failed with exit 
  status 252<BR></P>
  <DIV> </DIV>
  <DIV>my computer run both of cpus but he didn't share kpoint he only do the 
  same job with both cpus.</DIV>
  <DIV>please help me i really confused why it happended.</DIV>
  <DIV>sincerely yours</DIV>
  <DIV><BR><BR> </DIV>
  <DIV><SPAN class=gmail_quote>On 12/2/06, <B class=gmail_sendername>Amin 
  Babazadeh</B> <<A 
  href="mailto:babazade@gmail.com">babazade@gmail.com</A>> wrote:</SPAN> 
  <BLOCKQUOTE class=gmail_quote 
  style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Dear 
    Dr.Zhou and kohlmeyer <BR>Thanks a lot for your helps. i will try to do your 
    recommendation.<BR>Sincerely yours <BR>amin 
    <DIV><SPAN class=e id=q_10f4351f4ecd8c2f_1><BR><BR>
    <DIV><SPAN class=gmail_quote>On 12/2/06, <B class=gmail_sendername>Huiqun 
    Zhou</B> < <A onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
    href="mailto:hqzhou@nju.edu.cn" target=_blank>hqzhou@nju.edu.cn</A>> 
    wrote: </SPAN>
    <BLOCKQUOTE class=gmail_quote 
    style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid">
      <DIV bgcolor="#ffffff">
      <DIV><FONT face=Arial size=2>Amin,</FONT></DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>Sorry, I was out of the town and had no 
      access to my e-mail.</FONT></DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>1. You can use anyone of MPI implemetations. 
      But I recommend Intel MPI-2 because it's an</FONT></DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>  installable binary, it saves you as a 
      beginner a lot of time. If you cannot</FONT><FONT face=Arial size=2> get a 
      copy of that, </FONT></DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>  use OpenMPI, a successor of 
      LAM/MPI.</FONT></DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>2. Basically, when you recompile MPI, you can 
      add --prefix=/your/favourite/place to configure</FONT></DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>3. You need C compiler to compile 
      MPI. You need </FONT><FONT face=Arial size=2>gcc too. I 
      compiled MPI with icc + ifort.</FONT></DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>Good luck!</FONT></DIV><SPAN>
      <DIV> </DIV>
      <DIV><FONT face=Arial size=2>Huiqun</FONT> </DIV>
      <DIV>  </DIV></SPAN>
      <BLOCKQUOTE 
      style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: rgb(0,0,0) 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px"><SPAN>
        <DIV 
        style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal">----- 
        Original Message ----- </DIV>
        <DIV 
        style="BACKGROUND: rgb(228,228,228) 0% 50%; FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>From:</B> 
        <A title=babazade@gmail.com 
        onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
        href="mailto:babazade@gmail.com" target=_blank>Amin Babazadeh</A> </DIV>
        <DIV 
        style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>To:</B> 
        <A title=pw_forum@pwscf.org 
        onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
        href="mailto:pw_forum@pwscf.org" target=_blank>pw_forum@pwscf.org</A> 
        </DIV></SPAN>
        <DIV><SPAN>
        <DIV 
        style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>Sent:</B> 
        Thursday, November 30, 2006 3:17 PM</DIV>
        <DIV 
        style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>Subject:</B> 
        Re: [Pw_forum] use doual core</DIV>
        <DIV><BR> </DIV>
        <DIV>Thanks a lot for your answers.but until yet i couldn't solve my 
        problem.I confused about mpi. there are three kind of mpi in the 
        Internet (lam/mpi,openmpi,mpich) i don't know which one of them i should 
        install.</DIV>
        <DIV>about making the environment i should say that i am beginner in 
        using Linux so i use the ./configure commend and i didn't change any 
        path because i don't know how i should do it.</DIV>
        <DIV>i will appreciate if answer my question?</DIV>
        <DIV>1-which mpi do i need for my job?</DIV>
        <DIV>2-how could i change the path?</DIV>
        <DIV>3-is ifort compiler enough for installing mpi package?<BR>Thanks a 
        lot<BR> </DIV>
        <DIV><SPAN class=gmail_quote>On 11/27/06, <B 
        class=gmail_sendername>Huiqun Zhou</B> <<A 
        onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
        href="mailto:hqzhou@nju.edu.cn" target=_blank>hqzhou@nju.edu.cn</A>> 
        wrote: </SPAN>
        <BLOCKQUOTE class=gmail_quote 
        style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid">
          <DIV bgcolor="#ffffff">
          <DIV><FONT face=Arial size=2>Have you set up you environment for using 
          one the mpi libraries you installed in .bashrc?</FONT></DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>For example, for openmpi you need to set 
          following in your .bashrc if you are using bash</FONT></DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>as your shell:</FONT></DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>...</FONT></DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>export 
          PATH=/opt/openmpi/bin:$PATH</FONT></DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>export 
          LD_LIBRARY_PATH=/opt/openmpi/lib:$LD_LIBRARY_PATH</FONT></DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>...</FONT></DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>Note: you need to replace /opt/openmpi 
          with the path of your installation.</FONT></DIV><SPAN>
          <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
          <DIV><FONT face=Arial size=2>Huiqun Zhou</FONT></DIV></SPAN>
          <DIV><SPAN>
          <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
          <BLOCKQUOTE 
          style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: rgb(0,0,0) 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
            <DIV 
            style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal">----- 
            Original Message ----- </DIV>
            <DIV 
            style="BACKGROUND: rgb(228,228,228) 0% 50%; FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>From:</B> 
            <A title=babazade@gmail.com 
            onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
            href="mailto:babazade@gmail.com" target=_blank>Amin Babazadeh</A> 
            </DIV>
            <DIV 
            style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>To:</B> 
            <A title=pw_forum@pwscf.org 
            onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
            href="mailto:pw_forum@pwscf.org" 
            target=_blank>pw_forum@pwscf.org</A> </DIV>
            <DIV 
            style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>Sent:</B> 
            Sunday, November 26, 2006 6:11 PM</DIV>
            <DIV 
            style="FONT: 10pt arial; font-size-adjust: none; font-stretch: normal"><B>Subject:</B> 
            Re: [Pw_forum] use doual core</DIV>
            <DIV><BR> </DIV>
            <DIV>Dear Dr.Kohlmeyer</DIV>
            <DIV>Thanks a lot for your help.I did what you said.i installed 
            </DIV>
            <DIV>fftw-3.1.2.tar</DIV>
            <DIV>lam-7.1.2.tar</DIV>
            <DIV>mpich2-1.0.4p1.tar</DIV>
            <DIV>openmpi-1.1.2.tar</DIV>
            <DIV> on fedora core 5 and after that i configure the espresso 
            but this error was written</DIV>
            <DIV> </DIV>
            <DIV>WARNING: the following problems were detected:</DIV>
            <P> unsupported C/Fortran compilers 
            combination:<BR> CC=mpicc, F77=mpif77, F90=mpif90</P>
            <DIV>you may not be able to compile this program.</DIV>
            <DIV>i don't know what this problem means.would you please help 
            me.</DIV>
            <DIV>Thanks a lot</DIV>
            <DIV><BR><BR> </DIV>
            <DIV><SPAN class=gmail_quote>On 11/22/06, <B 
            class=gmail_sendername>Axel Kohlmeyer</B> <<A 
            onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
            href="mailto:akohlmey@cmm.chem.upenn.edu" 
            target=_blank>akohlmey@cmm.chem.upenn.edu </A>> wrote:</SPAN> 
            <BLOCKQUOTE class=gmail_quote 
            style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid">On 
              11/22/06, Amin Babazadeh <<A 
              onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
              href="mailto:babazade@gmail.com" target=_blank> 
              babazade@gmail.com</A>> wrote:<BR>> dear users <BR>> I 
              use a computer with a dual core CPU.but my problem is that when i 
              run a<BR>> program only one of the CPU work but i like to share 
              the work (solving k<BR>> points) between cpus. <BR>> I think 
              that i should install the parallel pwscf but when i run the 
              <BR>> ./configure only single pwscf installed.<BR><BR>you have 
              to install an MPI package (e.g. LAM/MPI, OpenMPI, MPICH) <BR>first 
              and then configure/compile quantum espresso with parallel support 
              <BR>as explained in the provided installation instructions. 
              <BR><BR>please make sure that your MPI package is compatible with 
              or compiled<BR>for the fortran compiler you want to use to 
              compiled quantum espresso with. <BR>precompiled packages may be 
              compiled for a different compiler and thus <BR>need special flags 
              or environment variables set to use the compiler of<BR>your 
              choice.<BR><BR>axel.<BR><BR>> would you please tell me or give 
              me a document that solve my problem. <BR>><BR>><BR>> 
              --<BR>> AMIN 
              <BR><BR><BR>--<BR>=======================================================================<BR>Axel 
              Kohlmeyer   <A 
              onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
              href="mailto:akohlmey@cmm.chem.upenn.edu" 
              target=_blank>akohlmey@cmm.chem.upenn.edu</A>   <A 
              onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
              href="http://www.cmm.upenn.edu/" 
              target=_blank>http://www.cmm.upenn.edu</A><BR>Center for Molecular 
              Modeling   --   University of Pennsylvania 
              <BR>Department of Chemistry, 231 S.34th Street, Philadelphia, PA 
              19104-6323<BR>tel: 1-215-898-1582,  fax: 
              1-215-573-6233,  office-tel: 1-215-898-5425 
              <BR>======================================================================= 
              <BR>If you make something idiot-proof, the universe creates a 
              better 
              idiot.<BR>_______________________________________________<BR>Pw_forum 
              mailing list <BR><A 
              onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
              href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" 
              target=_blank>Pw_forum@pwscf.org</A><BR><A 
              onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" 
              href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" 
              target=_blank>http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</A><BR></BLOCKQUOTE></DIV><BR><BR 
            clear=all><BR>-- <BR>AMIN 
        </BLOCKQUOTE></SPAN></DIV></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR><BR 
        clear=all><BR>-- <BR>AMIN 
    </SPAN></DIV></BLOCKQUOTE></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR><BR 
    clear=all><BR></SPAN></DIV>-- <BR><SPAN class=sg>AMIN 
  </SPAN></BLOCKQUOTE></DIV><BR><BR clear=all><BR>-- <BR>AMIN 
</BLOCKQUOTE></BODY></HTML>